পাইরিডক্সিন হাইড্রোক্লোরাইড শরীরে পাইরিডক্সাল ৫’-ফসফেটে রূপান্তরিত হয়, যা ভিটামিন বি৬ এর সক্রিয় কোএনজাইম রূপ। এটি অ্যামিনো অ্যাসিড বিপাক, নিউরোট্রান্সমিটার সংশ্লেষণ (যেমন, সেরোটোনিন, ডোপামিন, GABA), হিমোগ্লোবিন সংশ্লেষণ এবং লিপিড বিপাক জড়িত অসংখ্য এনজাইমেটিক বিক্রিয়ায় একটি কোফ্যাক্টর হিসাবে কাজ করে। এই কোএনজাইম কার্যকলাপ স্বাভাবিক স্নায়ুতন্ত্রের কার্যকারিতা, লোহিত রক্তকণিকা উৎপাদন এবং হোমোসিস্টিন নিয়ন্ত্রণের জন্য অপরিহার্য, যা সম্মিলিতভাবে চিকিৎসাগত প্রভাবগুলিতে অবদান রাখে।