অরনিডাজল একটি নাইট্রোইমিডাজল ডেরিভেটিভ যা অ্যানেরোবিক ব্যাকটেরিয়া এবং প্রোটোজোয়ার বিরুদ্ধে অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল কার্যকলাপ প্রদর্শন করে। এটি মাইক্রোবিয়াল কোষগুলিতে প্রবেশ করে এবং ইন্ট্রাসেলুলার ইলেক্ট্রন ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন দ্বারা এর নাইট্রো গ্রুপের রিডাক্টিভ সক্রিয়করণ হয়। এই সক্রিয়করণ সাইটোটক্সিক ফ্রি র্যাডিকেল এবং প্রতিক্রিয়াশীল মেটাবোলাইট তৈরি করে যা ডিএনএ এবং অন্যান্য গুরুত্বপূর্ণ জৈব অণুগুলির ক্ষতি করে, যার ফলে স্ট্র্যান্ড ভেঙে যায়, নিউক্লিক অ্যাসিড সংশ্লেষণ বাধাগ্রস্ত হয় এবং অবশেষে মাইক্রোবিয়াল কোষের মৃত্যু ঘটে।