এগোমেলাটিন মেলাটোনিন রিসেপ্টর MT1 এবং MT2 তে অ্যাগোনিস্ট হিসেবে কাজ করে, যা সার্কাডিয়ান রিদম নিয়ন্ত্রণ করতে এবং বিষণ্নতায় ব্যাহত ঘুমের ধরণ উন্নত করতে সাহায্য করে। উপরন্তু, এটি সেরোটোনিন 5-HT2C রিসেপ্টরগুলিতে একটি অ্যান্টাগোনিস্ট হিসাবে কাজ করে, যা ফ্রন্টাল কর্টেক্সে নোরপাইনফ্রাইন এবং ডোপামিনের মুক্তি বৃদ্ধি করে। এই দ্বৈত ক্রিয়া মেজাজের উন্নতি ঘটিয়ে এবং সার্কাডিয়ান রিদম স্বাভাবিক করে এর অ্যান্টিডিপ্রেসেন্ট প্রভাবগুলিতে অবদান রাখে, যেখানে যৌন কর্মহীনতার মতো সাধারণ SSRI পার্শ্বপ্রতিক্রিয়াগুলি এড়ানো যায়।